Dal 1971 è professore ordinario di Storia e sistemi dei rapporti tra Stato e Chiesa alla Facoltà di Scienze politiche “Alfieri” dell’Università di Firenze; precedentemente professore di diritto ecclesiastico all’Università di Urbino (1964-1968) e di Parma (1968-1971). Il professor Margiotta Broglio è uno dei più illustri studiosi italiani di diritto ecclesiastico e di storia dei rapporti fra Stato e Chiesa. Convinto sostenitore della laicità dello Stato, fra il 1983 e il 1987 ha fatto parte delle commissioni governative per la revisione del Concordato e per la stipula di intese con le confessioni religiose diverse dalla cattolica.